Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CDSNQ15517 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDSNQ15517 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDSNQ15517 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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CDSNQ15517 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CDSNQ15517 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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CDSNQ15517 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDSNQ15517 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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