Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SIX1Q15475 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SIX1Q15475 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
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