Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SYCP1Q15431 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
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SYCP1Q15431 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SYCP1Q15431 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
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