Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
TTF1Q15361 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TTF1Q15361 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
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