Protein–RNA interactions for Protein: Q15327

ANKRD1, Ankyrin repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD1Q15327 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ANKRD1Q15327 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ANKRD1Q15327 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms