Protein–RNA interactions for Protein: Q15306

IRF4, Interferon regulatory factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF4Q15306 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IRF4Q15306 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
IRF4Q15306 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
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