Protein–RNA interactions for Protein: Q15276

RABEP1, Rab GTPase-binding effector protein 1, humanhuman

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Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABEP1Q15276 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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RABEP1Q15276 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABEP1Q15276 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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