Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PCOLCEQ15113 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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