Protein–RNA interactions for Protein: Q14CN2

CLCA4, Calcium-activated chloride channel regulator 4, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCA4Q14CN2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CLCA4Q14CN2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CLCA4Q14CN2 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms