Protein–RNA interactions for Protein: Q14722

KCNAB1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNAB1Q14722 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
KCNAB1Q14722 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms