Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CKAP5Q14008 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CKAP5Q14008 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms