Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGA9Q13797 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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ITGA9Q13797 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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ITGA9Q13797 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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ITGA9Q13797 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ITGA9Q13797 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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