Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PMS2P11Q13670 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms