Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TUBB3Q13509 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TUBB3Q13509 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TUBB3Q13509 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TUBB3Q13509 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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TUBB3Q13509 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TUBB3Q13509 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
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