Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
GPM6BQ13491 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
GPM6BQ13491 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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