Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TCIRG1Q13488 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TCIRG1Q13488 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
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