Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
XRCC4Q13426 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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