Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SP140Q13342 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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SP140Q13342 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SP140Q13342 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
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