Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTGDRQ13258 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
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