Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
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ERCC8Q13216 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERCC8Q13216 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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