Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.781e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 26.15□□□□□ -1.421e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.341e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 EIF3B-210ENST00000468611 1868 ntTSL 214.32□□□□□ -0.121e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 EIF3B-207ENST00000465670 2766 ntTSL 214.01□□□□□ -0.171e-6■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 EIF3B-211ENST00000475415 3745 ntTSL 29.86□□□□□ -0.831e-6■■■□□ 14.7
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TARDBPQ13148 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.392e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 AP2M1-212ENST00000461733 1470 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 AP2M1-222ENST00000621863 1305 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.842e-7■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.792e-6■■■□□ 14.7
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TARDBPQ13148 ADNP-205ENST00000534467 773 ntTSL 36.98□□□□□ -1.291e-7■■■□□ 14.7
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TARDBPQ13148 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.457e-27■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.577e-27■■■□□ 14.7
TARDBPQ13148 CLK3-225ENST00000569063 833 ntTSL 520.32■□□□□ 0.843e-6■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 CLK3-209ENST00000562670 544 ntTSL 412.95□□□□□ -0.343e-6■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 CLK3-203ENST00000454830 3787 ntTSL 512.85□□□□□ -0.353e-6■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 CLK3-224ENST00000568605 1047 ntTSL 212.77□□□□□ -0.373e-6■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 CLK3-214ENST00000564096 805 ntTSL 212.06□□□□□ -0.483e-6■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 CLK3-201ENST00000345005 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.523e-6■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 EIF4G3-206ENST00000411888 1122 ntTSL 526.99■■□□□ 1.919e-8■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.139e-8■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 EIF4G3-202ENST00000356916 2179 ntTSL 1 (best) BASIC8.58□□□□□ -1.049e-8■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.682e-7■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 KDM2A-210ENST00000529006 6967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.482e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 KDM2A-213ENST00000531696 4160 ntTSL 510.9□□□□□ -0.672e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 KDM2A-201ENST00000308783 3666 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.792e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 KDM2A-212ENST00000530342 3651 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.892e-7■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.156e-9■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 FBL-204ENST00000594443 805 ntTSL 313.26□□□□□ -0.293e-14■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 DDX10-203ENST00000526794 6707 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.962e-7■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 28.7□□□□□ -1.023e-14■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC8.51□□□□□ -1.052e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-206ENST00000413150 6958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.45□□□□□ -1.062e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 VPS13B-210ENST00000521932 1055 ntTSL 38.02□□□□□ -1.132e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-212ENST00000456652 3855 ntTSL 5 BASIC7.95□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-219ENST00000625522 7458 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.212e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-221ENST00000634702 3800 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.282e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 FBL-202ENST00000593503 628 ntTSL 36.31□□□□□ -1.43e-14■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 MAP4K4-207ENST00000417294 4251 ntTSL 56.14□□□□□ -1.432e-7■■■□□ 14.6
TARDBPQ13148 AP2M1-217ENST00000476434 321 ntTSL 25.87□□□□□ -1.477e-12■■■□□ 14.6
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TARDBPQ13148 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.252e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-209ENST00000520638 2340 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.942e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-205ENST00000518802 2603 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-208ENST00000520548 572 ntTSL 47.71□□□□□ -1.182e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-211ENST00000521606 2658 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.232e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-201ENST00000274542 3364 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.42e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.462e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 CIR1-202ENST00000377973 561 ntTSL 38.4□□□□□ -1.063e-7■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.753e-6■■□□□ 14.5
TARDBPQ13148 TPTEP1-202ENST00000400593 1430 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.033e-6■■□□□ 14.5
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