Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
MKRN3Q13064 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
MKRN3Q13064 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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