Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PTP4A2Q12974 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
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