Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LMAN2Q12907 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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