Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
EFEMP1Q12805 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
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