Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SPOCK1Q08629 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SPOCK1Q08629 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms