Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PTPN12Q05209 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms