Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CYP4A11Q02928 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CYP4A11Q02928 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms