Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
NRG1Q02297 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NRG1Q02297 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms