Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SPIBQ01892 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SPIBQ01892 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms