Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SPTBN1Q01082 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms