Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
IRF9Q00978 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
IRF9Q00978 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms