Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
FANCCQ00597 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms