Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TFAMQ00059 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TFAMQ00059 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms