Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CRB1P82279 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CRB1P82279 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB1P82279 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB1P82279 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CRB1P82279 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms