Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms