Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SNRPNP63162 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms