Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
UFM1P61960 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
UFM1P61960 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms