Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VBP1P61758 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
VBP1P61758 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VBP1P61758 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
VBP1P61758 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms