Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HERV-K104P61576 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HERV-K104P61576 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms