Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
HERVK_113P61574 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
HERVK_113P61574 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms