Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
UBE2NP61088 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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