Protein–RNA interactions for Protein: P59037

LINC00313, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00313, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00313P59037 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.34□□□□□ -0.75
LINC00313P59037 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms