Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
H2BFSP57053 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2BFSP57053 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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H2BFSP57053 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
H2BFSP57053 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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