Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP2S1P53680 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms