Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LIMK2P53671 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LIMK2P53671 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms