Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CRIP1P50238 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms