Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
NESP48681 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
NESP48681 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
NESP48681 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
NESP48681 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
NESP48681 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
NESP48681 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
NESP48681 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
NESP48681 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms