Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
GABRA4P48169 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
GABRA4P48169 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms