Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MCAMP43121 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MCAMP43121 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MCAMP43121 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MCAMP43121 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms